蒙古人對(duì)當(dāng)時(shí)金朝政權(quán)下的北京城也進(jìn)行了殘酷的洗劫，每次攻下城后燒殺達(dá)幾個(gè)月之久，完全搶劫破壞后才撤離。公元1215年，成吉思汗攻陷金國(guó)都城中都（也就是現(xiàn)在的北京），對(duì)城中居民進(jìn)行了長(zhǎng)達(dá)一個(gè)月之久的大屠殺，超過(guò)100萬(wàn)人為此殞命，北京這個(gè)兩三千年的古城完全消失，現(xiàn)在的北京沒(méi)有任何元代以前的建筑，就是這個(gè)原因。
在元代以前，中國(guó)大的民族在中原有一大分支是羌族，羌族最大的一支黨項(xiàng)族，作為中國(guó)一個(gè)很有影響的民族就是在西夏時(shí)被蒙古人滅絕的。現(xiàn)在有些姓黨的人就是黨項(xiàng)族人后裔。公元1227年，屠夫鐵木真發(fā)泄獸欲時(shí)，被西夏婦女咬掉了'小弟弟'而最終惡貫滿(mǎn)盈于六盤(pán)山。其后，他的繼承者實(shí)現(xiàn)了對(duì)西夏的征服。出于報(bào)復(fù)，將西夏境內(nèi)的居民盡數(shù)屠戮。僅西夏都城興慶府（今銀川）就有超過(guò)80萬(wàn)的居民被屠殺，黨項(xiàng)民族也從此滅絕于中華大地。從此羌族在中國(guó)歷史上不再有影響力。
元代蒙古人建立橫跨歐亞大陸的蒙古大帝國(guó)時(shí)，連年征戰(zhàn)，頻繁征兵，能征善戰(zhàn)的契丹族人被征召殆盡，契丹人投靠了蒙古部落，隨戰(zhàn)爭(zhēng)分散到各地，在征討大理的時(shí)候發(fā)揮了很大的作用，有很多契丹人后來(lái)就定居在了云南。還有些契丹人就是現(xiàn)在的達(dá)斡爾人，他們就是的契丹人后裔。這就是契丹人為什么消失的歷史之迷。
蒙古人滅花剌子模，屠尋思干（撒馬爾罕）城約百萬(wàn)人口；滅西夏，屠八十余萬(wàn)。蒙古人數(shù)次西征，凡遇有抵抗，立即屠城，共屠數(shù)百城。整個(gè)中亞一片廢墟。1258年，旭列兀（拖雷的兒子，忽必烈的兄弟）的蒙古鐵騎攻陷巴格達(dá)，大屠巴格達(dá)居民。據(jù)說(shuō)120萬(wàn)人死于屠刀下，以至底格里斯河、河水為之一片血紅！巴比倫人慘遭滅絕。蒙古人的征服過(guò)程中，滅國(guó)無(wú)數(shù)，這場(chǎng)屠殺是如此的酷烈，許多民族被斬盡殺絕，從而使他們徹底的湮滅于人類(lèi)空前的兵兇中，典籍上對(duì)他們也只留下了只言片語(yǔ)的記載。
1279年，元軍與宋軍在崖山展開(kāi)了最后的決戰(zhàn)。混戰(zhàn)幾天后，宋軍不支，張世杰與陸秀夫決定撤退。只是，宋軍的船隊(duì)被元軍沖散，陸秀夫不愿被俘虜，眼含淚水背著小皇帝跳海自殺，此后，殘余的宋軍、官員及家眷也紛紛跳海殉國(guó)（史載：有數(shù)萬(wàn)之眾殉國(guó)），至此，南宋徹底滅亡。當(dāng)時(shí)滅宋的漢奸張弘范在崖山大石上還刻有十二個(gè)大字：
鎮(zhèn)國(guó)大將軍張弘范滅宋于此.
不過(guò)現(xiàn)在多出的兩個(gè)字，就是后人加上去的"漢奸"二字。
漢奸張弘范還寫(xiě)過(guò)一首詩(shī)："磨劍劍石石鼎裂，飲馬長(zhǎng)江江水竭。我軍百萬(wàn)戰(zhàn)袍紅，盡是江南兒女血"。這也說(shuō)明了當(dāng)時(shí)戰(zhàn)況和屠殺的慘烈。
遺落在福建一帶的南宋遺民，他們的后人就是現(xiàn)在的閩南客家人。
蒙古兵所到之處，想盡一些辦法把當(dāng)?shù)厝丝跉⒏蓛簟３酥苯油罋ⅲ€焚燒所有的糧倉(cāng)和房屋，使得逃走的百姓在冬天凍死，踐踏破壞農(nóng)田和灌溉系統(tǒng)，使得當(dāng)?shù)厝艘院笸耆珱](méi)有食物來(lái)源而餓死。用腐爛的尸體去污染水源，使得大量人口飲水后染上疾病而死亡。把老百姓趕到海里淹死。有些地方有幸存者，那是因?yàn)槊晒跑婈?duì)人少，一時(shí)找不到他們，或者是急著要出征別處，即使沒(méi)有來(lái)的及殺完，也就出征了，一點(diǎn)也不能說(shuō)明那些屠夫有半點(diǎn)殘余的良心。被屠殺城市的幸存者也住不滿(mǎn)城市一角。根據(jù)蒙古征服前和征服后人口數(shù)量推測(cè)蒙古人至少殺了多少人。很多中外歷史學(xué)家推測(cè)，中國(guó)北方至少有80%人口在蒙古入侵時(shí)死于非命。成吉思汗的有句名言："男子漢人生最快樂(lè)的事，就是殺人性命，奪盡其所有財(cái)產(chǎn)，使其根絕，令其親屬痛哭，再奸淫其妻女"。蒙古帝國(guó)在中國(guó)境內(nèi)的種族滅絕，作為世界記錄放在《吉尼斯世界記錄大全》1985年版。
那些來(lái)自蒙古的征服者似乎不認(rèn)為在自己統(tǒng)治下的老百姓是人，他們甚至經(jīng)常考慮把這些占地方的家伙都?xì)⒌簦缓蟀淹恋赜脕?lái)放牧（元史）。中國(guó)人甚至連姓名都不能有，只能以出生日期為名，不能擁有武器，只能幾家合用一把菜刀，漢人村里新媳婦的頭一夜一定要給蒙古保長(zhǎng)。在這種淫威下，漢民族有了一次大規(guī)模的向東南亞的外遷。