1944年伊犁、塔城和阿爾泰三個(gè)地區(qū)在蘇聯(lián)的支持下成立了“東突厥斯坦共和國”。蘇聯(lián)此舉是“醉翁之意不在酒”，其真正目的并不是支持新疆獨(dú)立，而是要以新疆問題做交換籌碼，迫使中國政府承認(rèn)外蒙古和蘇聯(lián)在中國東北的特權(quán)。1945年8月中蘇友好條約簽署，達(dá)到了蘇聯(lián)的預(yù)期目的，因此蘇聯(lián)要求“東突厥斯坦共和國”與國民黨政府談判，成立新疆省聯(lián)合政府。麥斯武德、伊敏、艾山等“東突”分裂分子也被安排在聯(lián)合政府中任職。由于“東突厥斯坦共和國”的實(shí)權(quán)掌握在反對新疆獨(dú)立的阿合買提江等人手中，因此最后“東突厥斯坦共和國”無果而終，但事實(shí)上的獨(dú)立一直維持到1949年解放新疆為止。因?yàn)檫@個(gè)伊斯蘭政權(quán)是反對國民黨的，而且并沒有公然提出分裂的口號，所以新疆解放以后，人民政府從團(tuán)結(jié)的角度出發(fā)，把這一事件稱為“三區(qū)革命”，作為中國新民主主義革命的一部分，并將民族軍改編為解放軍第5軍。但是這一事件的負(fù)面影響不容忽視。
新疆解放后，麥斯武德被關(guān)押，伊敏、艾山等再次聞風(fēng)而逃。“東突”分裂運(yùn)動(dòng)再次受到沉重打擊，但并沒有因此而絕跡，分裂主義思想并未徹底根除，其影響依舊存在。只要有合適的環(huán)境條件，又會(huì)迅速死灰復(fù)燃。
“東突”的發(fā)展
“東突”分裂運(yùn)動(dòng)在20世紀(jì)后期開始惡性發(fā)展，近年來第一個(gè)發(fā)展趨勢是聯(lián)合，由于歷史原因，長期以來“東突”分裂組織大多是在境外，活動(dòng)分散，而且規(guī)模和影響都較小。20世紀(jì)80年代以后，中國開始實(shí)行改革開放，蘇聯(lián)解體和中亞各國獨(dú)立，給“東突”分裂主義者卷土重來帶來了機(jī)遇。原先各自為政一盤散沙的“東突”分裂組織達(dá)成了統(tǒng)一集中發(fā)展的共識，提出了“統(tǒng)一組織、統(tǒng)一綱領(lǐng)、統(tǒng)一領(lǐng)袖、統(tǒng)一武裝、統(tǒng)一行動(dòng)”的目標(biāo)。先后出現(xiàn)了“伊斯蘭真主黨”、“伊斯蘭改革黨”等聯(lián)盟性質(zhì)的組織。
1992年12月，“東突”分裂主義者在沙特、土耳其的資助下，在伊斯坦布爾召開了“東突厥斯坦民族代表大會(huì)”，來自中亞、美國、澳大利亞、巴基斯坦、德國、沙特、土耳其、瑞士等國的30多個(gè)分裂組織的頭目參加了大會(huì)。在此次大會(huì)上成立了“東突厥斯坦國際民族聯(lián)合委員會(huì)”，確定了國名（東突厥斯坦國）、國旗（月牙旗）、國歌（夏迪雅）和國徽，標(biāo)志著境外“東突”分裂主義運(yùn)動(dòng)走向聯(lián)合。
1993年4月5日，美國、德國、法國、巴基斯坦、沙特及中亞等17個(gè)國家的“東突”分裂組織代表再次在土耳其舉行了“東突厥斯坦”國際會(huì)議，宣布建立統(tǒng)一流亡政府，任命熱扎彼肯為“政府首腦”，發(fā)表了獨(dú)立宣言，并呼吁聯(lián)合國、國際人權(quán)組織和伊斯蘭組織向中國施加壓力，還聲稱將與“民運(yùn)”組織、達(dá)賴集團(tuán)進(jìn)行“聯(lián)合行動(dòng)”。
1996年10月在和田，來自新疆十幾個(gè)州（縣）的分裂組織代表舉行會(huì)議，宣布成立“伊斯蘭真主黨”，通過了黨綱、組織建設(shè)等七項(xiàng)文件，這標(biāo)志著境內(nèi)分裂勢力開始由分散走向聯(lián)合。
第二個(gè)發(fā)展趨勢是國際化。90年代以后，“東突”分裂組織逐漸從地下轉(zhuǎn)為公開，并開始朝著國際化趨勢發(fā)展。中亞地區(qū)“東突”分裂勢力的總頭目莫哈里索夫就曾公開表示：“要實(shí)現(xiàn)獨(dú)立，沒有國際的支持不行，沒有西方的支持不行，僅有少數(shù)國家的支持也不行。要打‘國際牌’，使新疆問題國際化”。近年來，“東突”分裂組織更是明確推行國際化的策略：擴(kuò)大在中亞、西亞等伊斯蘭國家的政治影響和生存空間，淡化分裂活動(dòng)的民族宗教色彩，而是將所謂民族宗教問題與人權(quán)問題掛鉤，把分裂活動(dòng)提升為“民族解放運(yùn)動(dòng)”，以爭取西方大國的支持。為此，分裂組織的頭目頻繁與西方大國接觸，并連年在西方國家舉行的聽證會(huì)上作證，到處舉辦“東突厥斯坦問題”國際研討會(huì)、展覽會(huì)，并不斷組織示威活動(dòng)，同時(shí)充分發(fā)揮因特網(wǎng)等現(xiàn)代通訊傳媒的作用，擴(kuò)大影響。