11月27日記者獲悉，上海交通大學醫學院附屬仁濟醫院消化科研究員陳豪燕和研究員洪潔團隊，首次揭示了腸道真菌具有預測腫瘤免疫治療療效的作用，且腸道真菌預測準確性較細菌更高。該研究為篩選腫瘤免疫治療的應答者及提高免疫治療的適用性提供了新思路。研究成果日前在線發表于《細胞》子刊《細胞·宿主與微生物》。
腫瘤免疫檢查點抑制劑（ICB）的研發是癌癥治療的重大突破。然而，只有一小部分癌癥患者對ICB治療有應答反應。近年來，越來越多的研究表明，腸道菌群結構能影響癌癥患者使用ICB的有效性。然而，人體腸道菌群的構成主要由飲食和生活方式決定，不同地區或人種間的腸道菌群構成存在明顯差異。因此，先前研究中與ICB療效相關的腸道菌群特征結果并不一致。
為了解決這個問題，有學者對相關研究進行了整合分析，以確定在不同研究中普遍存在的能預測ICB應答的細菌，并對細菌的預測性能進行了評估。然而，腸道細菌的預測效果并不令人滿意。
真菌是人類腸道微生物群中不可或缺的一部分，在塑造宿主免疫和維持腸道內穩態方面起著至關重要的作用。但腸道真菌與ICB應答的關系目前尚不清楚。
此項研究整合了來自不同國家、不同腫瘤類型的使用ICB治療的患者的9個宏基因組隊列，同時計算了腸道真菌及細菌雙界微生物組豐度，發現了可用于預測ICB治療應答的真菌及細菌標志物。研究團隊通過構建隨機森林模型，預測癌癥患者對ICB的應答反應。
結果顯示，腸道真菌具有良好的預測效能且其預測效能比細菌更高。此外，整合細菌及真菌雙界標志物進行預測時會達到最好的預測效能。根據真菌標志物預測的ICB治療的應答者，其腫瘤免疫微環境中有更多的耗竭性T細胞浸潤，且該類患者的生存期優于不應答者。雙界網絡分析及微生物功能預測分析表明，真菌能在應答者腸道中將淀粉發酵成短鏈脂肪酸，從而促進ICB治療的應答。
“這項研究首次揭示了ICB治療的應答者及不應答者全面的泛癌腸道真菌譜，發現了具有良好預測性能的雙界微生物標記物，突出了真菌在預測免疫治療療效方面的潛力，有望提高ICB治療的適用性，為利用雙界微生物標記物預測ICB療效、改善應答提供新思路。”陳豪燕認為。（記者王春）